Nature:全新致癌选择性,相分离驱动异常染色质成环,促进癌症发展

2022-02-28 05:55 来源:宣城妇科医院

乳癌的发展与载本体亚基质内在无序区如前所述(IDR)的DNA精神状态密切相关。各种亚基质(包括核苷酸系数、肝细胞膜调节剂和RNA联结亚基)中都的IDR通过凝胶-凝胶密切相关(LLPS)构成紧密联结可作,影响从细胞膜器构成和刺激环境温度到DNA核苷酸的无数生可作流程。

所谓的凝胶-凝胶密切相关(LLPS)是指交融两个不相关DNA等位基因的流程。该流程愈演愈烈在肝细胞膜内,并能够构成具有各种可作理特持续性的如前所述,这些如前所述可以有助于乳癌,例如急持续性乳腺癌的愈演愈烈发展。在急持续性乳腺癌中都,核孔亚基(NUP98或NUP214)的每一次染色本体易位产生了一种精神状态交融本体,它心里原有核孔亚基 IDR——谷氨酸和氨基酸残基(FG)的并联密集单调核酸。然而,IDR如何导致DNA错误调控和愈演愈烈尚不清楚。

2021年6月23日,北边弗吉尼亚所大学教堂山分校 Gang Greg Wang 一个团队等 Nature 发表了题为:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的学术研究论文。

该学术研究归功于密切相关是乳癌构成的特别设计各种因素,乳癌通过密切相关获得等位基因以建立有毒核苷酸系数紧密联结可作,这同时弱化了它们的DNA组载本体持续性并在转换成流程中都游离精神状态三维肝细胞膜结构的构成。该学术研究是最早将密切相关与乳癌构成联系起来的学术研究之一。因为在其他恶持续性中都观察到了类似的DNA交融,文章中都阐释的组态也可以解读其他一般来说的乳癌。

NUP98–HOXA9涵盖两个亚基质基序和一个联结核酸。为了学术研究NUP98-IDR在乳腺癌愈演愈烈中都的抑制作用,学术研究一个团队主要用作敲除了联结核酸的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。

他们挖掘出,N-IDRWT/A9对1,6-己二醇(一种用于摧毁相-密切相关紧密联结本体的糖类)处理敏感。化学合成的NUP98-IDR(N-IDR)亚基在本体外构成黏稠紧密联结可作。

为了进一步检验FG单调核酸对紧密联结可作构成的浓度依靠持续性和多价持续性的重要持续性,学术研究一个团队制备了含有不同数量FG单调核酸的重组N-IDR亚基质。他们挖掘出N-IDR涵盖38个或36个FG以浓度依靠持续性的方式单调构成的凝胶滴,那些涵盖27个或11个FG的却不能进行密切相关。表明NUP98–HOXA9中都的IDR以价依靠和浓度依靠的方式建立LLPS。

NUP98–HOXA9通过同源结构如前所述与DNA联结,导致乳腺癌愈演愈烈流程中都的DNA嗜睡。每一次,学术研究一个团队通过肝细胞膜免疫沉淀和生物信息学测序来检验IDR特异性的密切相关对NUP98–HOXA9肝细胞膜载本体持续性的影响。

最近, N-IDRWT/A9具有祚着弱化的DNA组占有率,而与无统筹聚类并不一定的峰值亚类所谓。此外,宽而密集的;也弱化子样峰是N-IDRWT/A9所独有的,并且在发育期和乳腺癌相关DNA富集。

为了进一步检验IDR游离的LLPS在不相关的肝细胞膜载本体中都的抑制作用,他们借助了遗传学和微生物学的方式,归功于IDR特异性的LLPS在弱化嵌合核苷酸系数载本体持续性不足之处的因果抑制作用,特别是在;也弱化子样峰处看到的那些。表明IDR弱化交融本体的DNA组联结并且弱化靶DNA酪氨酸。

为了测试NUP98–HOXA9通过LLPS构成肝细胞膜反转的战斗能力,学术研究一个团队转换成了表达N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9细胞膜的Hi-C图谱,揭示了DNA反转和脱氧核糖核酸彼此间的高度相关持续性。

为了确定N-IDRWT/A9对Hi-C接触基频的影响,他们围住了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9表达细胞膜中都500个最强烈的N-IDRWT/A9占据基因座彼此间的相互抑制作用计数。最近,N-IDRWT/A9反转以基本上与CTCF所谓的方式构成,与密切相关特别设计组态相一致。另外,N-IDRWT/A9特异持续性反转更进一步通往弱化子和靶DNA彼此间的通往,拥护了交融核苷酸系数的IDR通过密切相关在;也弱化子样靶点和癌DNA彼此间游离DNA反转的观点。

综上所述,该学术研究挖掘出NUP98–HOXA9中都含有的LLPS活持续性IDR对乳腺癌的愈演愈烈和有毒DNA表达流程的酪氨酸至关重要。这些效应由IDR的战斗能力特异性:1)弱化核苷酸系数与DNA组靶点的联结;2)有助于弱化子和癌DNA特异持续性彼此间的中都距离反转。

该学术研究备有了一个有毒等位基因的原理持续性确实,该等位基因在转换成流程中都有助于LLPS特别设计的核苷酸系数联结和3D肝细胞膜重组。由于含IDR的LLPS活持续性分子与广泛的乳癌有关,该学术研究阐释的组态也可以解读其他一般来说的乳癌。

早期出处:

Ahn, J.H., Dis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.

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